Según las bases, durante el desarrollo de esta etapa, en caso de igualdad en puntaje luego del segundo partido, se aplicará lo normado por la FIFA para determinar al ganador:
1- Pasará a la siguiente fase el club que obtenga mayor diferencia de goles.
2- En caso de existir de igualdad de goles, se contará doble el gol marcado en el terreno del equipo adversario (de visita)
3- Si aún así persistiera la igualdad se ejecutará la serie de tiros desde el punto penal conforme a las Normas de la FIFA hasta definir al ganador.
El Campeón Nacional de la Copa Perú ascenderá a la Primera División profesional en forma directa y el Subcampeón a la Segunda División.
Los Clubes eliminados en esta etapa, retornarán a jugar la Etapa Regional, de acuerdo a la región que corresponda. (WGN)