-Fue separado por no haber participado en la Segunda
CNI fue excluido de la Copa del Inca 2012 al considerarse que no podría ser incluido debido a que el cupo inicial que ocupaba en este nuevo certamen correspondía al de un equipo perteneciente a la segunda división del fútbol nacional, por lo que el bosquejo con la distribución de equipos de este certamen quedó «arruinado en la composición de sus llaves», señala el portal de fútbol de chalaca.com.
Explica la web que «no obstante, el formato de la Copa es el mismo, al igual que el número de participantes; es decir, con 32 equipos, los cuales están distribuidos de la siguiente manera: los 16 equipos del Descentralizado 2012 y los 10 elencos de la Segunda División 2012, además de seis invitados de la Copa Perú por mérito deportivo -los equipos que se ubicaron del cuarto al noveno lugar en el torneo de 2011-). Sin embargo, la primera gran sorpresa en este pelotón de equipos es la inclusión de la Universidad San Marcos, elenco que por no presentar su aval de la temporada 2012 junto a la amortización de las deudas en 2011 fue excluido del torneo de ascenso para la presente temporada».
Los albos al quedar fuera de esta competencia dan lugar a Defensor Zarumilla de Nasca, que por merito deportivo, al ubicarse en el noveno lugar de la Copa Perú 2011, se adjudicó un lugar en la primera edición de la Copa del Inca.
